Военный учебно-научный центр Военно-воздушных сил «Военно-воздушная академия имени Николая Егоровича Жуковского и Юрия Алексеевича Гагарина» создано на базе Военного авиационного инженерного университета и став до одного из лучших учебных заведений Министерства обороны Российской Федерации. Образовательную деятельность ведут факультеты и кафедры, размещенные как в самом Воронеже, так и в филиалах: в Челябинске и Сызрани, научно-исследовательские центры и другие структурные подразделения. В академии функционируют докторантура и адъюнктура очной формы обучения. Для защиты кандидатских и докторских диссертаций действуют шесть диссертационных советов по 14 научным специальностям. Также осуществляется подготовка адъюнктов иностранных государств.

Структура Военно-воздушной академии имени Жуковского и Гагарина

21 февраля 2020 года министр обороны России, генерал армии Сергей Шойгу на торжественной церемонии в Национальном центре управления обороной, вручил Военно-воздушной академии имени Николая Егоровича Жуковского и Юрия Алексеевича Гагарина» Орден Жукова. Награда вручена за заслуги в укреплении обороноспособности и подготовке кадров.

21 ноября 2019 года Указом Президента России Владимира Путина Военный учебно-научный центр Военно-воздушных сил «Военно-воздушная академия имени Николая Егоровича Жуковского и Юрия Алексеевича Гагарина» награждена государственной наградой - орденом Жукова, за заслуги в укреплении обороноспособности страны и подготовке квалифицированных военных кадров.

23 апреля 2012 года, распоряжением Правительства РФ №609-р проведена реорганизация путем слияния Военного учебно-научного центра ВВС «Военно-воздушная академия имени профессора Н.Е. Жуковского и Ю.А. Гагарина» и Военного авиационного инженерного университета. В результате образован Военный учебно-научный центр Военно-воздушных сил «Военно-воздушная академия имени профессора Н.Е. Жуковского и Ю.А. Гагарина», с дислокацией в городе Воронеж. 

12 июля 2011 года, приказом Министерства обороны РФ №1136 подготовка обучающихся из Военно-воздушной академии имени профессора Н.Е. Жуковского и Ю.А. Гагарина передана в Военный авиационный инженерный университет, в Воронеже.

24 декабря 2008 года, распоряжением Правительства РФ N1951-р к Военно-воздушной академии имени профессора Н.Е. Жуковского и Ю.А. Гагарина был присоединен ряд военных училищ, в качестве обособленных структурных подразделений, и академия получила наименование «Военный учебно-научный центр Военно-воздушных сил «Военно-воздушная академия имени профессора Н.Е. Жуковского и Ю.А. Гагарина».

7 марта 2008 года, распоряжением Правительства РФ №283-р в ведении Министерства обороны создано федеральное государственное военное образовательное учреждение высшего профессионального образования «Военно-воздушная академия имени профессора Н.Е. Жуковского и Ю.А. Гагарина». Новое учебное учреждение сформировано путем реорганизации в форме слияния, находящихся в ведении Министерства обороны, Военно-воздушной инженерной академии имени Н.Е. Жуковского и Военно-воздушной академии имени Ю.А. Гагарина с местом дислокации в подмосковном Монино. 

В 2002 году вновь было возвращено название Военно-воздушная инженерная академия и имя профессора Н.Е. Жуковского.

В 1998 году при очередной реорганизации военного образования академия была переименована в Военный авиационный технический университет. Петровский дворец, в течение 75 лет бывший главным корпусом, сердцем и одним из символов академии, был передан в ведение мэрии Москвы, а штаб академии переехал в дом №3 на Планетной улице.

В 1968 году академии присвоено имя космонавта Юрия Алексеевича Гагарина.

9 сентября 1951 года на торжественном построении личного состава от имени Президиума Верховного Совета СССР училищу было вручено Боевое Знамя.

1 января 1950 года Приказом Министра Вооруженных Сил СССР в Сталинграде открылось военное училище, которое получило название Военное аэродромно-техническое училище ВВС

6 августа 1946 года академия переименована в Военно-воздушную инженерную академию имени профессора Н.Е. Жуковского. В соответствии с решением Министерства обороны СССР начато формирование радиотехнического факультета. Создан летно-экспериментальный отдел академии, кафедры реактивного управляемого вооружения, пилотажно-навигационных комплексов и управляемых ракет, лучистой энергии. Создан стенд для испытания турбореактивных двигателей.

29 марта 1940 года на базе курсов усовершенствования начальствующего состава создана Военная академия командного и штурманского состава ВВС Красной Армии. Из состава академии выделились оперативный, командный и штурманский факультеты, образовав Военную академию командно-штурманского состава с месторасположением в поселке Монино Московской области.

29 марта 1940 года Народный комиссар обороны СССР маршал Советского Союза Климент Ворошилов, подписал приказ о создании Военной академии командно-штурманского состава ВВС. На базе командного, штурманского, оперативного факультетов, академия начала подготовку инженерно-технического состава военно-воздушных сил СССР. Позднее, в 1968 году Академия была переименована в Военно-воздушную академию имени Юрия Гагарина.

29 января 1927 года произведен первый выпуск слушателей командного факультета.

17 апреля 1925 года академия переименована в Военно-воздушную академию РККА имени профессора Н.Е. Жуковского. В первые годы существования в академии было два факультета: инженерный и службы Воздушного Флота.

9 сентября 1922 года издан приказ Реввоенсовета о введении нового штата института с присвоением ему наименования Академия Воздушного Флота имени Н.Е. Жуковского.

23 ноября 1920 года Революционный военный совет утвердил положение об Институте инженеров Красного Воздушного Флота имени Николая Жуковского. Академия положила начало высшему образованию в подготовке военных кадров для авиации, стояла у истоков авиационной науки. Все последующее развитие системы образования Военно-воздушных сил неразрывно связано с ней.

26 сентября 1920 года Реввоенсовет СССР издал приказ № 1946, которым постановил реорганизовать Московский авиатехникум в Институт инженеров Красного Воздушного Флота имени Николая Егоровича Жуковского.