Апти Аухадов родился 18 ноября 1992 года а городе Урус-Мартан, Чеченская Республика. Тренируется под руководством своего отца - Хамзата Аухадова. В 14 лет выполнил норматив мастера спорта России, показав 72,5 + 90 в категории 46 кг. В 17 лет выполнил норматив мастера спорта России международного класса, подняв 170 + 210 в категории 85 кг.
В сборной команде России с 2005 года. Серебряный призер чемпионата Европы 2011 года, серебряный призер первенства мира среди юниоров 2011 года, Чемпион мира 2010 года среди юниоров, серебряный призер первенства Европы 2009 года среди юниоров. Чемпион России 2010 года среди юниоров. Обладатель Кубка России 2010 года. Чемпион России 2015 года.
В 2012 году 3 августа завоевал серебряную медаль на летних Олимпийских играх 2012 года в Лондоне. Победитель Универсиады 2013 года в Казани. Чемпион Европы 2013 года в Тиране. Чемпион мира 2013 года во Вроцлаве.
В 2016 году 18 октября по решению МОК был лишен олимпийской медали из-за того, что в его допинг-пробе были обнаружены запрещенные препараты. В ответ Аухадов заявил, что подчиняется решению олимпийского комитета.