Владимир Дорофеев родился 17 сентября 1968 года в городе Санкт-Петербург. После школы, в 1991 году молодой человек с отличием окончил Санкт-Петербургский государственный морской технический университет. Став дипломированным специалистов устроился в акционерное общество «Санкт-Петербургское Морское Бюро Машиностроения «Малахит».
До 1992 года работал в качестве инженера. В дальнейшем, занимал должности инженера-конструктором III, II категории. С 1996 по 1997 год являлся начальником сектора.
Дорофеев в 1997 году назначен на должность заместителя главного конструктора по новейшему кораблю: опытному глубоководному техническому средству освоения Мирового океана, не имеющему себе равных в отечественном и мировом подводном кораблестроении.
С 1998 года возглавил представительство конструкторского бюро на заводе-строителе корабля: Федеральном Государственном Унитарном Предприятии «ПО Севмаш». В 2007 году участвовал в качестве технического руководителя в проведении завершающей стадии испытаний корабля: глубоководном погружении на предельную глубину, рекордную для этого класса кораблей.
В том же году Владимир Юрьевич назначен заместителем генерального конструктора направления глубоководных технических средств. В 2008 году стал первым заместителем генерального директора - главным инженером акционерного общества «СПМБМ «Малахит».
С 15 августа 2011 года Владимир Юрьевич Дорофеев занимает должность генерального директора АО «Санкт-Петербургское Морское Бюро Машиностроения «Малахит».
В 2012 году Международный союз научных и инженерных общественных объединений присвоил Дорофееву Владимиру звание «Инженер десятилетия».
Параллельно с основной работой Дорофеев является членом Совета по кораблестроению при правительстве Российской Федерации, членом научного совета РАН по комплексной проблеме «Гидрофизика», членом научно-технического общества «Судостроителей» и других организаций, председателем государственной аттестационной комиссии в СПбГМТУ «Корабелка». Состоит в редакциях научно-технических журналов, часто выступает с докладами на научных конференциях и симпозиумах, а также со статьями в различных изданиях.
За заслуги в разработке и внедрении новейших образцов техники и оборудования для морского флота России, в Екатерининском зале Кремля 27 ноября 2018 года Президент Российской Федерации Владимир Путин вручил Дорофееву Владимиру Юрьевичу Орден «За морские заслуги».
Юбилейная медаль «300 лет Российскому флоту»
Орден Мужества
Орден «За морские заслуги»
Международный союз научных и инженерных общественных объединений присвоил звание «Инженер десятилетия»