Ильшат Фазрахманов родился 8 августа 1977 года в деревне Трунтаишево, Республика Башкортостан. Окончил Башкирский государственный аграрный университет по специальности «ветеринария» и «бухгалтерский учет и контроль». Трудовую деятельность начал непосредственно по окончании высшего учебного заведения.
Начиная с 1999 года, Фазрахманов приступил к работе в ОАО «Раевский сахарный завод», где последовательно замещал должности заместителя главного бухгалтера, бухгалтера-программиста и заместителя генерального директора по производству сельхозпродукции.
В 2002 году, опытный управленец занял должность директора Общества с Ограниченной Ответственностью «Сельскохозяйственное предприятие «БашАгроСахар».
С 2002 по 2003 год, работал в качестве исполнительного директора ООО «Лион-Агро».
Позднее, с 2003 по 2008 год, работал главным специалистом отдела экономической политики, главным консультантом отдела экономики, финансов и внешних связей Управления экономической и социальной политики Администрации Президента Республики Башкортостан.
В 2008 году, перешел на должность главного консультанта, а затем, советника отдела по работе с территориями Управления по работе с территориями, кадрового обеспечения и государственных наград Администрации Президента Республики Башкортостан.
С 2010 года, Ильшат Ильдусович занимал пост заведующего сводно-аналитическим отделом. Так же, являлся заместителем начальника управления - заведующим отделом инфраструктурного развития Контрольно-аналитического управления Администрации Президента РБ.
В 2012 году, назначен заведующим отделом развития агропромышленного комплекса и природопользования Аппарата Правительства Республики Башкортостан. С 2012 по 2015 год, руководил департаментом вышеупомянутого ведомства.
С 2015 года, являлся Главой Администрации муниципального района «Давлекановский район», Республика Башкортостан.
На протяжении 2016 - 2017 года, занимал пост министра сельского хозяйства РБ.
Впоследствии, Фазрахманов Ильшат Ильдусович назначен на должность исполняющего обязанности заместителя Премьер-министра - министра сельского хозяйства Республики Башкортостан.