Сергей Коротков родился 18 июля 1959 года в городе Анива, Сахалинская область. В 1983 году, будущий конструктор окончил Московский авиационный институт имени Серго Орджоникидзе по специальности «самолето-вертолетостроение».
Карьеру, молодой специалист начал в 1983 году, с должности инженера на Машиностроительном Заводе имени Сухого. Далее, Коротков занимал должность Инженера. Впоследствии замещал пост инженера-конструктора 3 категории и инженера - конструктора 2 категории на родном предприятии. В период с 1986 по 1988 год, Сергей Коротков проходил военную службу в вооруженных силах Советского Союза, в войсковой части №51065, расположенной в городе Моршанск, Тамбовская область. После увольнения в запас, инженер вернулся на родное предприятие и возобновил рабочую деятельность в должности инженера-конструктора 1 категории.
Далее, Коротков занял должность ведущего конструктора. Позднее назначен заместителем главного конструктора. Через определенный промежуток времени, высококлассный специалист назначен главным конструктором ОАО «ОКБ «Сухого». В 2000 году, Сергей Сергеевич получил дополнительное образование, окончив курс обучения по программе: «Основы управленческой деятельности», Современные методы управления предприятием, Стандарты серии ИСО Философия и практика ТМ». Впоследствии, Сергей Коротков замещал пост директора по координации программ - директора программы. Далее, вплоть до 2006 года являлся заместителем Генерального директора ОАО «ОКБ «Сухого». В период с 2006 по 2009 год, работал первым заместителем Генерального директора ОАО «Компания Сухой». В 2009 году, занял должность первого заместителя Генерального директора компании ОАО «РСК «МиГ».
В 2010 году, конструктор вновь повысил уровень личного образования, окончив Академию народного хозяйства при Правительстве РФ по специальности «стратегическое управление». С 2011 по 2016 год, Сергей Сергеевич являлся Генеральным директором АО «РСК «МиГ». В 2015 году избран членом Правления ПАО «ОАК». В конце февраля 2016 года, Коротков Сергей Сергеевич вступил в должность Генерального конструктора - Вице-президента по инновациям ПАО «ОАК-Объединенная Авиастроительная Корпорация». В сентябре того же года, назначен председателем совета директоров АО «РСК «МиГ».
В разные периоды трудовой и общественной деятельности, Сергей Коротков отмечен государственными наградами и знаками отличия. Является лауреатом разнообразных премий. Кандидат технических наук.
Женат, имеет двух сыновей.