Анатолий Судаков родился 3 июня 1955 года в селе Малиновка, Саратовская область. Происходит из многодетной крестьянской семьи. В 1972 году, юноша окончил Малиновскую среднюю школу. В период с 1973 по 1975 год, молодой человек проходил срочную службу в рядах Советской армии.

В ноябре 1975 года, после увольнения из вооруженных сил в запас, Анатолий устроился алтарником в Михаило-Архангельский собор города Сердобск, Пензенской области, где настоятелем служил один из самых заметных клириков Пензенской и Саранской епархии архимандрит Модест. В октябре 1977 года, принят послушником в братство Троице-Сергиевой лавры. Далее, 30 марта 1978 года, наместником лавры архимандритом Иеронимом пострижен в монашество с наречением имени Варсонофий в честь святителя Варсонофия, епископа Тверского, а 27 апреля того же года, архиепископом Дмитровским Владимиром рукоположен в сан иеродиакона. Вскоре, 26 ноября 1978 года, служителю церкви присвоен очередной сан – иеромонах. В 1979 году, священнослужитель окончил Московскую Духовную Семинариию.

Позже, в 1982 году, священник возведен в сан игумена. В лавре нес послушание помощника ризничего и помощника благочинного. В период с 1982 по 1986 год, Варсонофий обучался в Московской духовной академии, где защитил кандидатскую диссертацию по истории Афона. Во время обучения в Московских духовных школах каникулярное время ежегодно проводил в Пюхтицком монастыре в Эстонии, где не раз сослужил митрополиту Таллиннскому и Эстонскому Алексию, будущему Святейшему Патриарху Московскому и всея Руси. Впоследствии, после окончания МДА по просьбе епископа Пензенского и Саранского Серафима направлен на пастырское служение в Пензенскую епархию. С 15 сентября 1986 года, являлся настоятелем Казанской церкви города Кузнецка Пензенской области. В 1987 году, возведен в сан архимандрита. С15 июня 1988 по 7 февраля 1991 года, занимал должность настоятеля Успенского собора города Пенза. Являлся секретарем Пензенского епархиального управления.

Рукоположен в архиерейский сан 8 февраля 1991 года семнадцатью епископами в городе Москва. В феврале 2001 года, возведен в сан архиепископа. Определением Священного Синода от 31 марта 2009 года, Варсонофий назначен исполняющим обязанности управляющего делами Московской Патриархии. В период с 2009 по 2013 год являлся председателем Наградной комиссии при Патриархе Московском и всея Руси. Позднее, решением Священного Синода от 25 декабря 2009 года, священнослужитель утвержден в должности управляющего делами Московской Патриархии. Во внимание к усердному служению Церкви Божией и в связи с назначением управляющим делами Московской Патриархии - постоянным членом Священного Синода - возведен 1 февраля 2010 года в сан митрополита. Входит в состав Высшего Церковного Совета Русской Православной Церкви с 22 марта 2011 года. Решением Священного Синода от 5-6 октября 2011 года, назначен главой новообразованной Мордовской митрополии.

Так же, решением Священного Синода от 4 октября 2012 года, священник утвержден в должности настоятеля - священноархимандрита Иоанно-Богословского мужского монастыря села Макаровка, Республики Мордовия, а 19 марта 2014 года, религиозный деятель назначен Преосвященным Санкт-Петербургским и Ладожским, главой Санкт-Петербургской митрополии. Является постоянным членом Священного Синода с временным сохранением должности управляющего делами Московской Патриархии.