Российский военный деятель. Воевода, Боярин, Князь. Глава Семибоярщины. Являлся одним из руководителей думской аристократии. Последний князь-Гедиминович из рода Мстиславских. Старший сын главного московского воеводы и боярина князя Ивана Федоровича Мстиславского.
Федор Мстиславский родился 10 июня 1550 года в городе Москва. Он был старшим сын главного московского воеводы Ивана Федоровича Мстиславского. Службу начал в 1575 году кравчим. Осенью 1576 года князь Федор Иванович впервые назван боярином и возглавил передовой полк в походе на Кесь в армии своего отца. Город был взят, после чего армия направлена к Колывани под командованием князя. Безрезультатная осада города продолжалась семь недель.
В государевом походе в Ливонию осенью 1577 года князь возглавлял передовой полк, откуда в январе 1578 года был переведен командовать полком правой руки в армию, отправленную отбивать вновь захваченную Кесь. Город выдержал - простояв четыре недели и сделав пролом в стене русская армия вынуждена была прекратить осаду.
Уже в мае 1578 года князь Федор Иванович Мстиславский переброшен на юг и возглавляет передовой полк в «береговой» армии. В следующем 1579 году назначение в передовой полк «береговой» армии повторяется.
Осенью 1579 года князь на короткий срок назначается первым воеводой в Новгород. В 1580 году в разряде «на берег» его первоначально расписывают первым воеводой правой руки, но в итоге в действующей армии он заменяет отца на посту первого воеводы большого полка.
В июне 1581 года князь Мстиславский возглавлял передовой полк в армии из пяти полков, собранной в Зубцове против наступающих войск Стефана Батория, откуда в январе 1582 года был переброшен в Новгород возглавлять армию, посланную против Шведов, однако по распоряжению царя поход состоялся ограниченными силами, а князь остался охранять Новгород, откуда к 22 апреля был переброшен командовать «береговой армией», которую он покинул летом, чтобы возглавить передовой полк в армии, собранной в Волоколамске.
В 1586 году, после ссылки отца, назначен первым боярином в думе.
Мстиславский, «сидевший» по знатности рода в Боярской думе на самом высоком месте, пережил многочисленные перипетии Смутного времени неизменно на ведущих ролях, не подвергаясь опале: он пробыл первым думским боярином тридцать шесть лет, причем на московском престоле сменилось семеро царей. Он получал самое большое жалование в русском государстве - 1200 рублей в год.
В 1598 году после смерти Федора Иоанновича назывался среди претендентов на престол; в дальнейшем Борис Годунов не позволял ему жениться, опасаясь появления конкурирующей династии. Мстиславский сам не желал царствовать и предпочел сыграть в русской Смуте роль «делателя королей», хотя его имя как возможного монарха звучало еще дважды.
Возглавил правительственные войска против Лжедмитрия I, был разбит под Новгород-Северским и ранен, затем одержал победу при Добрыничах и безуспешно осаждал Кромы. После прихода самозванца к власти не терял влияния, оставаясь первым боярином. Незадолго до вступления Лжедмитрия в Москву над Мстиславским нависла серьезная угроза - ведавший политическим сыском Семен Годунов, выяснивший двойную игру опытного боярина, распорядился его убить, однако не успел привести замысел в исполнение и вскоре сам расстался с жизнью.
Уже в следующем году Мстиславский вновь оценил обстановку и участвовал в заговоре против Лжедмитрия, кончившемся его убийством. Затем водил войска против восстания Болотникова. После свержения Василия Шуйского политическая роль Мстиславского резко возросла, он возглавил Семибоярщину, участвовал в избрании царем Владислава Сигизмундовича, а после изгнания поляков - Михаила Романова.
На Федоре Мстиславском его род пресекся, так как дети его умерли в младенчестве. Мстиславские владели, в частности, обширными поместьями по реке Черемухе, которые были завещаны Федором Ивановичем Симонову монастырю, где была семейная усыпальница Мстиславских.
Федор Иванович Мстиславский скончался 16 декабря 1622 года в Москве.