Игорь Мужжухин родился 4 февраля 1962 года в городе Новосибирск. В 1983 году окончил Училище искусств в городе Ростов-на-Дону. В 1989 году окончил актерский факультет Российской академии театрального искусства, ГИТИС, мастерскую Э. Быстрицкой. Состоял в труппе Театра юного зрителя в городе Ростов-на-Дону, где принимал участие в спектаклях Кирилла Серебренникова.

С 1995 года выступает на сцене театра на Таганке. Работал на канале ТВЦ в качестве ведущего программы «Настроение». Участвовал в съемках фильмов: «Записки сумасшедшего, или житие Аксентия Поприщина, титулярного советника», «Графиня де Монсоро», «Раздетые», «Белый танец», «Советское игристое».

Окончил Высшие курсы сценаристов и режиссеров, мастерскую Андрея Смирнова и Натальи Рязанцевой. В 2000 году по собственному сценарию снял короткометражную игровую картину «Джин-тоник». В 2002 году дебютировал в полнометражном игровом фильме «Вовочка», сняв его по собственному сценарию, который выиграл государственный грант.