Эрнст Неизвестный родился 9 апреля 1925 года в городе Свердловск. В 1947 году окончил рижскую Академию художеств, а в 1954 году - Московский художественный институт им. В.И. Сурикова, параллельно слушал лекции на философском факультете МГУ.
Во время Великой Отечественной Войны Неизвестный принимал участие в сражениях, в результате получил тяжёлые ранения и был отправлен домой. Отголоски войны надолго останутся в памяти художника и будут запечатлены на его холстах. Позднее его работы становятся более экспрессивными и сочетают элементы символизма и кубизма.
В 1955 году Эрнст Иосифович становится членом секции скульпторов Московского отделения Союза художников СССР и до 1976 года занимается художественной деятельностью в СССР.
С 1956 года он работал над претворением в жизнь своего грандиозного проекта – гигантской скульптуры «Древо жизни», которая стала символом творческого союза науки и искусства. Среди других его работ: «Цветок лотоса» на Асуанской плотине в Египте – памятник в честь дружбы народов, самая большая скульптура в мире – его высота 75 м.. Мемориал жертвам ГУЛАГА в Магадане – с огромным бетонным «Ликом скорби», надгробие Н.С. Хрущева в духе символизма и некоторые другие. Одна из последних работ Эрнста Неизвестного - памятник Сергею Дягилеву, установленный в Перми.
В 1976 году Эрнст Неизвестный эмигрировал в Цюрих, Швейцария, а в 1977 году переехал в США. В 1980-х годах он много раз выставлялся в галерее Магна в Сан-Франциско, где его выставки имели большой успех, и работал по заказу этой галереи. В эти же годы Неизвестный читал лекции в университетах Орегона в городе Юджин и в университете Беркли в Калифорнии.
В настоящее время Эрнст Иосифович живет в Нью-Йорке и работает в Колумбийском университете. Тем не менее, он часто приезжает в Россию, где выступает с докладами и делится опытом по сочетанию архаики и авангарда в искусстве. Эрнст Неизвестный - Зарубежный почетный член Российской академии художеств, лауреат Государственной премии РФ, кавалер орденов Почета и «За заслуги перед Отечеством» III степени.
В Уттерсберге существует музей его скульптур, а первый в России Художественный Музей Эрнста Неизвестного был открыт в Екатеринбурге 9 апреля 2013 года, в день 88-летия скульптора. В музее представлена экспозиция работ, полученных в дар как от самого Неизвестного, так и из других коллекций.