После освобождения Южного Сахалина в сентябре 1945 года приказом командования Дальневосточного военного округа были организованы управления по гражданским делам. В состав Сикукского района вошли управления по гражданским делам города Сикука и три сельские (волостные) Чириэ, Найро, Томарикиси. До января 1946 года гражданские управления существовали наряду с японскими административными органами. Постановлением Военного Совета Дальневосточного военного округа от 30 декабря 1945 года японское губернское управление, как самостоятельный административный руководящий орган был сокращен. Указом Президиума Верховного Совета РСФСР от 5 июня 1946 года «Об административно-территориальном устройстве Южно-Сахалинской области» были переименованы все районные центры, образован Поронайский район с центром в г. Поронайске (бывший Сикука).

    В обстановке перехода от военных действий к мирной жизни на гражданское управление возлагались обязанности по обеспечению порядка, национализации и организации работы промышленности, транспорта, торговли, сельского хозяйства и заготовок; организация работы коммунальных и бытовых учреждений, учет гражданского населения, руководство работой органов народного образования, здравоохранения, культуры и другие функции по нормализации жизни, по введению советских законов. Непосредственное руководство отраслями народного хозяйства гражданское управление осуществляло через свои отделы.

    Решением Сахалинского облисполкома от 26 февраля 1947 года были ликвидированы все районные и городские управления по гражданским делам с передачей всех дел, штатов и имущества вновь созданным районным и городским организационным исполкомам.

   Поронайский горисполком образован решением Сахалинского облисполкома 139 от 22 апреля 1947 года.

    Указом Президиума Верховного Совета РСФСР № 741/30 от 31 августа 1956 года Поронайский городской и Поронайский районный Советы объединены в Поронайский городской Совет депутатов трудящихся. Территория районов сохранена, как территориальная единица, поселковые и сельские Советы, и сельские Советы депутатов трудящихся переданы в подчинение городскому Совету.

    С октября 1977 года Советы депутатов трудящихся переименованы в советы народных депутатов.

    На основании Постановления Президиума Верховного Совета РСФСР «О временном положении о председателях и президиумах местных Советов народных депутатов РСФСР» решением первой сессии городского Совета от 30 марта 1990 был образован президиум Поронайского городского Совета народных депутатов. На этой же сессии было образовано 8 постоянных комиссий городского Совета.

    Решением первой сессии от 3 мая 1990 года утверждена структура и штаты городского Совета, а от 17 мая 1990 г. образован был отдел по работе с Советами.

    В соответствии с Законом РСФСР «О местном самоуправлении в РСФСР» решением восьмой Сессии городского Совета от 31 октября 1991 года президиум городского Совета народных депутатов был распущен и избран малый Совет. На этой же сессии был утвержден новый регламент работы городского Совета народных депутатов. На основании утвержденного регламента были упразднены постоянные комиссии городского Совета, образованные первой сессией, кроме мандатной. Этим же решением были образованы 4 новые постоянные комиссии городского Совета.

    На основании Указа президента Российской Федерации № 1760 от 26 октября 1993 года «О реформе местного самоуправления в Российской Федерации» был ликвидирован Поронайский городской Совет народных депутатов.

    На основании Постановления Верховного Совета РСФСР от 6 июля 1991 года «О порядке введения в действие Закона РСФСР» ст. 3 Указа Президента РСФСР от 22 августа 1991 года № 75 «О некоторых вопросах деятельности органов исполнительной власти в РСФСР», ст. 4 и Постановления Губернатора области № 49 от 12 декабря 1991 года, вступив в должность первого мэра Поронайского района Шапранов Владимир Михайлович постановил прекратить полномочия исполнительного комитета городского Совета народных депутатов с 12 декабря 1991 года.

    Муниципальное образование «Поронайский район» образовано в соответствии с решением Поронайского районного Собрания № 132 от 16 декабря 1996 года. Муниципальное образование «Поронайский район» наделено статусом городского округа в соответствии с Законом Сахалинской области № 524 от 21 июля 2004 года «О границах и статусе муниципальных образований Сахалинской области».

    В соответствии с решением Поронайского районного Собрания депутатов от 19 мая 2006 года № 68 муниципальное образование «Поронайский район» преобразовано в  муниципальное образование городской округ «Поронайский».

    Дата образования муниципального образования городской округ «Поронайский» считается 13 июня 2006 года (дата регистрации Устава МО ГО «Поронайский» Главным управлением Министерства юстиции Российской Федерации по Дальневосточному федеральному округу). Официальное наименование муниципального образования - муниципальное образование городской округ «Поронайский».

    27 июля 2012 г. путем объединения МО «Городской округ «Вахрушев» и МО «Городской округ «Поронайский» образовано МО Поронайский городской округ.

---

30 марта 1988 года постановлением Совета Министров РСФСР создан Государственный природный заповедник федерального значения «Поронайский». Расположен в Поронайском районе, в восточной части острова Сахалин в пределах наиболее расширенной части Тымь-Поронайской низменности и южной части Центрального хребта Восточно-Сахалинских гор.