Армия освобождения Косово 28 февраля 1998 года объявила войну за освобождение территории. Между албанскими повстанцами и Республикой Югославией вспыхнул вооруженный конфликт, вошедший в историю как Косовская война. Боевые действия спровоцировали косовские албанцы, стремившимися к независимости Косова и Метохии, что привело к большим жертвам обеих сторон.

В январе 1998 года Армия Освобождения Косова - АОК начала нападения на мирных жителей и полицейские патрули на территории автономного края. Начало вооруженной борьбы за независимость края она провозгласила 28 февраля 1998 года. Тогда же произошло первое серьезное столкновение между вооруженными албанцами и силами югославского МВД в районе Дреницы. Этот район считался «вотчиной» радикальных сторонников АОК.

В ходе полицейской операции был убит один из лидеров АОК Адем Яшари. Этот инцидент привлек внимание международной общественности к конфликту и стал причиной его интернационализации. Уже в марте 1998 года Совет безопасности ООН ввел военные санкции против Югославии. В этом бою были убиты несколько десятков членов АОК, силы МВД также понесли потери.

Вплоть до апреля 1998 года силы югославской армии в лице дислоцированного в крае 52-го Приштинского корпуса дистанцировались от боевых действий. Однако с началом атак албанцев на военные объекты они были вовлечены в бои. В апреле часть армейских подразделений приостановили повседневную боевую подготовку, провели мобилизацию личного состава и начали принимать участие в операциях против АОК. В этот период также начались нападения на югославские пограничные заставы.

Весной 1998 года большую часть операций по уничтожению повстанцев вели силы югославской полиции. С увеличением частоты столкновений армия привлекла к участию в боях силы военной полиции, а сводные отряды полиции были усилены бронетехникой. Кроме сводных отрядов полиции в автономный край были отправлены также силы специального назначения.

Весной-летом 1998 года численность АОК росла. В начале мая силы МВД близ Джяковицы были атакованы группой уже из 200 человек. В связи с ростом числа атак армия была вынуждена применять бронетехнику и артиллерию. В начале июня силы армии и полиции предприняли операцию по ликвидации формирований АОК в окрестностях Дечан и Джяковицы.

Район боев был закрыт для представителей прессы, однако в сообщениях журналистов говорилось о «настоящей войне между террористами и полицией». Участие армии в боях возросло, так как армейское командование посчитало, что полиция не может справиться с повстанцами.

Силы армии и МВД предприняли крупную операцию против АОК в районах Дреницы и по всей Метохии 25 июля. Она продолжалась до 29 сентября. В момент ее начала до половины территории края контролировалось членами АОК, чья численность в районах операции, по югославским оценкам, достигала 20 000 бойцов. Югославским силовикам удалось нанести поражение повстанцам, после чего их активность в этих районах была существенно снижена.

В период с 24 марта по 10 июня 1999 года была проведена военная операция НАТО против Союзной Республики Югославия. Причиной интервенции войск НАТО была названа волна этнических чисток в регионе. Результатом операции НАТО было завершение Косовской войны. Контроль над регионом перешел к силам НАТО и албанской администрации.

В марте 1999 года в конфликт вмешалось НАТО, приступив к бомбардировкам Югославии. В июне 1999 года, согласно Военно-техническому соглашению, подписанному представителями НАТО и югославской армии в Куманове, контроль над краем перешел к международным силам под руководством НАТО. Произошел массовый отток неалбанского населения, и многочисленные преступления против тех из них, кто остался в крае. Косовские албанцы провозгласили Республику Косово 17 февраля 2008 года.