Новосибирский метрополитен принят в эксплуатацию Госкомиссией 28 декабря 1985 года. По длине эксплуатируемых линий он занимает 155-е место в мире, одиннадцатое - среди метрополитенов бывшего СССР, после Московского, Петербургского, Киевского, Харьковского, Минского, Бакинского, Ташкентского, Тбилисского, Нижегородского и Казанского, пятое - в России.

В 1954 году при разработке градостроительного плана Новосибирска было разработано и предложено три различных варианта плана развития города, каждый из которых предполагал строительство метрополитена. Вновь вопрос о проектировании подземного метрополитена был поставлен в 1962 году при разработке нового плана развития Новосибирска.

Город, будучи крупным центром промышленности, культуры и науки, быстро рос, а 9 июля 1962 года в Новосибирске родился миллионный житель, что давало право на строительство метрополитена. В 1968 году городские власти поручают разработку проекта метрополитена институту «Новосибгражданпроект». В конце 1970 года разработка «Схемы развития городского транспорта Новосибирска до 2000 года» была завершена и 15 февраля следующего года ее передали на рассмотрение и согласование вначале в городской, а затем в областной исполком.

Согласно разработанной в институте схеме, Новосибирский метрополитен включал три линии общей протяженностью 52 километра с 36 станциями. В местах пересечения линий были запланированы четыре пересадочных узла. После того, как идея строительства метро в Новосибирске получила одобрение союзных министерств и ведомств, а также лично Леонида Брежнева, в августе 1972 года приехавшего в Новосибирск, дальнейшая разработка проекта была передана институту «Бакметропроект» - филиалу «Метрогипротранса».

В 1974 году был разработан новый вариант технико-экономического обоснования. Проект первой очереди метрополитена протяженностью 13,1 километров с одиннадцатью станциями был утвержден 12 декабря 1978 года Советом Министров РСФСР, а в союзном Совете Министров - месяцем ранее.

Датой начала строительства считается 12 мая 1979 года, когда состоялся торжественный митинг, посвященный началу возведения метрополитена, в ходе которого была забита первая свая. С начала 1980 года начались работы по первому участку Дзержинской линии, включавшему две станции: «Вокзальная» и «Нарымская».

В 1983 году за одну смену туннелепроходчики построили 3,86 метра тоннеля от «Спортивной» в сторону «Студенческой», установив рекорд того времени. В следующем году он был побит - было пройдено четыре метра за смену. Новосибирский метрополитен 28 декабря 1985 года был принят в эксплуатацию Государственной комиссией.

Спустя декаду после приемки, 7 января 1986 года, метрополитен официально открывает свои двери для пассажиров. В торжественной обстановке 31 декабря 1987 года был запущен первый участок Дзержинской линии из двух станций - «Сибирской» и «Площадь Гарина-Михайловского», 26 июля 1991 года принимается в эксплуатацию станция «Площадь Маркса», а 2 апреля 1992 года - станции «Гагаринская» и «Заельцовская».

А следующая станция - «Маршала Покрышкина» была введена в эксплуатацию только 28 декабря 2000 года. А вместе с ней был запущен в эксплуатацию правый перегонный 1,58 километровый тоннель - до станции «Площадь Гарина-Михайловского». Следующая же станция, «Березовая роща», появилась только еще через 5 лет, к 25 июня 2005 года.

Станцию «Золотая Нива» открыли 7 октября 2010 года, и 26 октября она была закрыта по решению суда на 30 суток в связи с конструкционными проблемами. Инициатива по закрытию станции принадлежала Ростехнадзору. Станция с самого начала была открыта в усеченном виде - с одним перегонным тоннелем, правым. Повторно станцию открыли только 9 февраля 2011 года.