В ночь на 7 октября 1941 года только что сформированный полк Московского командного училища имени Верховного Совета РСФСР был поднят по тревоге. Совершив за 36 часов под проливным дождем 85-километровый марш-бросок, курсанты заняли отведенный им участок обороны вдоль берега реки Лама. В течение двух месяцев, несмотря на тяжелейшие потери и непрекращающиеся атаки гитлеровцев, полк героически сдерживал наступление немецких войск в направлении Москвы. За время упорных боев кремлевцы нанесли фашистам значительные потери.

К октябрю 1941 года для Советских войск оборонявших Москву сложилась чрезвычайно сложная ситуация. Неприятель стремительно продвигался к столице, сосредоточив на главных участках наступления колоссальные силы. На Московском направлении были сосредоточены силы немецкой группы армий «Центр» общей численностью в 1 929 406 военнослужащих, в том числе 78 дивизий. На вооружении группы армий находились около 2 тысяч танков и самоходных артиллерийских установок, 14 тысяч артиллерийских орудий и минометов, 780 самолетов.

Для обороны столицы Сталин сосредоточил силы нескольких фронтов. Только Западный, Резервный и Брянский фронты насчитывали 1 250 000 человек. На защиту Москвы были брошены практически все силы, которыми располагала Красная Армия в районе столицы. Гражданское население было мобилизовано на строительство укреплений.

Тем временем, гитлеровцы стремительно продвигались в сторону Москвы. Войска противника 3 октября ворвались в Орел, 6 октября силы вермахта заняли Брянск и Карачев. Три советские армии - 3-я, 13-я и 50-я - попали в окружение под Брянском, а командовавший Брянским фронтом генерал-полковник Андрей Еременко получил серьезное ранение и был эвакуирован в Москву на специальном самолете.

Крайне неблагоприятно складывалась обстановка и в районе Вязьмы. Здесь 37 дивизий, 9 танковых бригад, 31 артиллерийский полк и управления 19-й, 20-й, 24-й и 32-й армий попали в окружение. Более 688 тысяч советских солдат и офицеров попали в плен, причем в числе пленных были командующий 19-й армией генерал-лейтенант Михаил Лукин и бывший командующий 32-й армией генерал-майор Сергей Вишневский. Командующий 24-й армией генерал-майор Константин Ракутин погиб. Вырваться из окружения удалось лишь 85 000 бойцов.

Сил, которые можно было бы задействовать в обороне столицы, становилось все меньше. В резерве оставались курсанты военных училищ Московской области. Решением ставки Верховного Главнокомандования 6 октября 1941 года формируется отдельный кремлевский полк из числа курсантов. В десяти курсантских ротах было 1 330 курсантов, 130 красноармейцев и 112 офицеров училища. Командиром полка назначен начальник училища Герой Советского Союза полковник Семен Младенцев.

Отдельный курсантский полк училища, совершив за сутки 85-километровый марш по маршруту озеро Сенежское-Клин-Новопетровское-Волоколамск, 12 октября 1941 года принял в составе 16-й армии Рокоссовского первый бой на Волоколамском направлении на восточном берегу реки Лама. Курсанты приняли бой в двух километрах на юго-запад от Яропольца, в районе деревни Гусево.

После перехода Советских войск в общее контрнаступление под Москвой 6 декабря 1941 года отдельный курсантский полк был расформирован, поскольку выполнил поставленную задачу по обороне Москвы. Курсанты старших курсов, получив звание лейтенант, были направлены в части действующей армии, а командный и преподавательский состав и 158 курсантов вернулись в училище, так как война потребовала резко усилить подготовку общевойсковых командиров.

За мужество и отвагу, проявленные в боях за Москву, 59 курсантов и 30 офицеров были награждены орденами и медалями. В память о них на Главном корпусе училища открыта мемориальная доска. Потери полка в боях под Москвой составили 811 человек. На братской могиле в селе Ярополец, в которой захоронено около 500 Кремлевских курсантов и 200 бойцов Красной армии, установлен памятник.

Училище вернулось в Москву 28 января 1942 года. Всего за годы Великой Отечественной войны было произведено 19 выпусков и подготовлено более 24 000 командиров.