Женский футбольный клуб «Краснодар» - создаваемая на базе ФК «Кубаночка» и ФК «Краснодар» новая женская команда, для выступления в Первенстве России по футболу. Условия для тренировок, инфраструктура будут на уровне других команд клуба. Финансирование основной и юношеской команды осуществляется ФК «Краснодар». Благодаря инфраструктуре клуб сможет привлекать новых занимающихся на любительском и профессиональном уровнях. Проект позволит расширить количество женских футбольных клубов в России и повысит популярность этого вида спорта.

4 февраля 2020 года ФК «Краснодар» и администрация Краснодарского края договорились о создании на базе клуба и ФК «Кубаночка» новой женской футбольной команды, в рамках снижения государственного участия в профессиональном футболе. Для функционирования клуба создадут все условия, а также откроется набор девочек в филиалы Академии. Благодаря проекту, поддержанному Сергеем Галицким, увеличится количество женских футбольных команд в российской Премьер-лиге.

19 января 2007 года по инициативе администрации Краснодарского края возрожден футбольный клуб «Кубаночка». Тренером стала воспитанница кубанского футбола, экс-игрок клубов России и Германии Татьяна Зайцева. Ее помощником стала еще одна бывшая футболистка Наталья Дыгай.

В 2001 году по завершении чемпионата России по футболу, из-за тяжелых финансовых проблем краснодарская команда «Кубаночка» снялась с соревнований и прекратила свое существование.

В 1993 году женский футбольный коллектив из Краснодара стал называться «Кубаночка» и заявился в чемпионат России среди команд второй лиги. Шефство над клубом взяла администрация Октябрьского района города. Главным меценатом стал заместитель руководителя администрации Вячеслав Буренок. В команде выступали девушки 15-17 лет, поэтому силы участников конечно же были неравны. И команда финишировала последней в зоне «ЮГ» чемпионата России Второй лиги. 

В 1992 году «Седин-Шисс» включена в состав команд высшей лиги чемпионата России. Дебютный сезон для кубанских девушек складывался удачно. По ходу чемпионата коллектив располагался в середине турнирной таблицы. Но из-за недостатка финансовых средств краснодарский футбольный клуб был вынужден сняться с соревнований, так и не закончив чемпионат.

25 января 1988 года в Краснодаре образован и стал функционировать первый футбольный женский клуб «Жемчужина». Его основателем, главным тренером и президентом стал Александр Такмаков. Через год краснодарская команда была переименована в «Седин-Шисс».