В Чеченской Республике с 00:00 по московскому времени 16 апреля 2009 года официально снят режим контртеррористической операции. По поручению президента России Дмитрия Медведева Национальным антитеррористическим комитетом внесены изменения в антитеррористическую деятельность на территории Чечни. Директором ФСБ России Александром Бортниковым отменен приказ, объявляющий республику Чечня зоной проведения контртеррористических операций.
С указанного времени мероприятия по борьбе с терроризмом в Чечне осуществлялись в соответствии с общим порядком, действующим в других регионах страны. Такое решение призвано обеспечить условия для дальнейшей нормализации обстановки в республике, восстановления и развития ее социально-экономической сферы.
Оперативному штабу в Чечне даны поручения, направленные на оптимизацию состава сил и средств Объединенной группировки войск по проведению контртеррористических операций на территории Северо-Кавказского региона, совершенствование порядка их применения в современных условиях.
Впервые эту тему поднял Дмитрий Медведев 27 марта. В поручении директору ФСБ и одновременно руководителю НАК Александру Бортникову он предложил рассмотреть вопрос о снятии режима контртеррористической операции в связи с тем, что обстановка в Чеченской Республике нормализовалась.
При этом особо подчеркивалось, что спецслужбы должны продолжить контроль за ситуацией и при необходимости вводить отдельные элементы режима КТО, а также проводить необходимые действия как в самой республике, так и в других южных республиках страны, где еще сохраняется угроза террористических актов.
Юридическая отмена режима контртеррористической операции означает снятие спецрежимов, связанных с функционированием аэропорта, таможни. По различным данным, всего на территории Чечни действовали 480 боевиков. В основном речь идет о наемниках и отдельных радикалах, несогласных сложить оружие ни при каких обстоятельствах.
Контртеррористическая операция федеральных сил в Чечне началась осенью 1999 года после вторжения с территории республики, находящейся под контролем сепаратистов, отрядов боевиков под командованием Шамиля Басаева и арабского наемника Хаттаба в Дагестан. Так, в начале августа 1999 года было совершено массированное нападение на высокогорные Ботлихский и Цумадинский районы Дагестана, а через месяц, в начале сентября, - на Новолакский район республики с попыткой захватить город Хасавюрт.
В обоих случая после нескольких недель боев захваченные села были освобождены от боевиков, после чего преследовавшие их федеральные войска вошли на территорию Чечни. Президент России Борис Ельцин 23 сентября 1999 года подписал указ о создании Объединенной группировки войск на Северном Кавказе с включением в ее состав формирований всех силовых министерств и ведомств, а также о подготовке контртеррористической операции на территории Чечни. В результате операции республика перешла под контроль российских силовых структур.